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1.

Genomic characterization of metastatic patterns from prospective clinical sequencing of 25,000 patients.

Nguyen, Bastien; Fong, Christopher; Luthra, Anisha; Smith, Shaleigh A; DiNatale, Renzo G; Nandakumar, Subhiksha; Walch, Henry; Chatila, Walid K; Madupuri, Ramyasree; Kundra, Ritika; Bielski, Craig M; Mastrogiacomo, Brooke; Donoghue, Mark T A; Boire, Adrienne; Chandarlapaty, Sarat; Ganesh, Karuna; Harding, James J; Iacobuzio-Donahue, Christine A; Razavi, Pedram; Reznik, Ed; Rudin, Charles M; Zamarin, Dmitriy; Abida, Wassim; Abou-Alfa, Ghassan K; Aghajanian, Carol; Cercek, Andrea; Chi, Ping; Feldman, Darren; Ho, Alan L; Iyer, Gopakumar; Janjigian, Yelena Y; Morris, Michael; Motzer, Robert J; O'Reilly, Eileen M; Postow, Michael A; Raj, Nitya P; Riely, Gregory J; Robson, Mark E; Rosenberg, Jonathan E; Safonov, Anton; Shoushtari, Alexander N; Tap, William; Teo, Min Yuen; Varghese, Anna M; Voss, Martin; Yaeger, Rona; Zauderer, Marjorie G; Abu-Rustum, Nadeem; Garcia-Aguilar, Julio; Bochner, Bernard.

Cell ; 185(3): 563-575.e11, 2022 02 03.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35120664

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9147702
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2022.01.003

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2.

Discovering dominant tumor immune archetypes in a pan-cancer census.

Combes, Alexis J; Samad, Bushra; Tsui, Jessica; Chew, Nayvin W; Yan, Peter; Reeder, Gabriella C; Kushnoor, Divyashree; Shen, Alan; Davidson, Brittany; Barczak, Andrea J; Adkisson, Michael; Edwards, Austin; Naser, Mohammad; Barry, Kevin C; Courau, Tristan; Hammoudi, Taymour; Argüello, Rafael J; Rao, Arjun Arkal; Olshen, Adam B; Cai, Cathy; Zhan, Jenny; Davis, Katelyn C; Kelley, Robin K; Chapman, Jocelyn S; Atreya, Chloe E; Patel, Amar; Daud, Adil I; Ha, Patrick; Diaz, Aaron A; Kratz, Johannes R; Collisson, Eric A; Fragiadakis, Gabriela K; Erle, David J; Boissonnas, Alexandre; Asthana, Saurabh; Chan, Vincent; Krummel, Matthew F.

Cell ; 185(1): 184-203.e19, 2022 01 06.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34963056

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8862608
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.12.004

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3.

Limb development genes underlie variation in human fingerprint patterns.

Li, Jinxi; Glover, James D; Zhang, Haiguo; Peng, Meifang; Tan, Jingze; Mallick, Chandana Basu; Hou, Dan; Yang, Yajun; Wu, Sijie; Liu, Yu; Peng, Qianqian; Zheng, Shijie C; Crosse, Edie I; Medvinsky, Alexander; Anderson, Richard A; Brown, Helen; Yuan, Ziyu; Zhou, Shen; Xu, Yanqing; Kemp, John P; Ho, Yvonne Y W; Loesch, Danuta Z; Wang, Lizhong; Li, Yingxiang; Tang, Senwei; Wu, Xiaoli; Walters, Robin G; Lin, Kuang; Meng, Ruogu; Lv, Jun; Chernus, Jonathan M; Neiswanger, Katherine; Feingold, Eleanor; Evans, David M; Medland, Sarah E; Martin, Nicholas G; Weinberg, Seth M; Marazita, Mary L; Chen, Gang; Chen, Zhengming; Zhou, Yong; Cheeseman, Michael; Wang, Lan; Jin, Li; Headon, Denis J; Wang, Sijia.

Cell ; 185(1): 95-112.e18, 2022 01 06.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34995520

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8740935
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.12.008

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4.

Transition to invasive breast cancer is associated with progressive changes in the structure and composition of tumor stroma.

Risom, Tyler; Glass, David R; Averbukh, Inna; Liu, Candace C; Baranski, Alex; Kagel, Adam; McCaffrey, Erin F; Greenwald, Noah F; Rivero-Gutiérrez, Belén; Strand, Siri H; Varma, Sushama; Kong, Alex; Keren, Leeat; Srivastava, Sucheta; Zhu, Chunfang; Khair, Zumana; Veis, Deborah J; Deschryver, Katherine; Vennam, Sujay; Maley, Carlo; Hwang, E Shelley; Marks, Jeffrey R; Bendall, Sean C; Colditz, Graham A; West, Robert B; Angelo, Michael.

Cell ; 185(2): 299-310.e18, 2022 01 20.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35063072

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8792442
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.12.023

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5.

SARS-CoV-2 mRNA vaccination elicits a robust and persistent T follicular helper cell response in humans.

Mudd, Philip A; Minervina, Anastasia A; Pogorelyy, Mikhail V; Turner, Jackson S; Kim, Wooseob; Kalaidina, Elizaveta; Petersen, Jan; Schmitz, Aaron J; Lei, Tingting; Haile, Alem; Kirk, Allison M; Mettelman, Robert C; Crawford, Jeremy Chase; Nguyen, Thi H O; Rowntree, Louise C; Rosati, Elisa; Richards, Katherine A; Sant, Andrea J; Klebert, Michael K; Suessen, Teresa; Middleton, William D; Wolf, Joshua; Teefey, Sharlene A; O'Halloran, Jane A; Presti, Rachel M; Kedzierska, Katherine; Rossjohn, Jamie; Thomas, Paul G; Ellebedy, Ali H.

Cell ; 185(4): 603-613.e15, 2022 02 17.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35026152

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8695127
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.12.026

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6.

Developmental and temporal characteristics of clonal sperm mosaicism.

Yang, Xiaoxu; Breuss, Martin W; Xu, Xin; Antaki, Danny; James, Kiely N; Stanley, Valentina; Ball, Laurel L; George, Renee D; Wirth, Sara A; Cao, Beibei; Nguyen, An; McEvoy-Venneri, Jennifer; Chai, Guoliang; Nahas, Shareef; Van Der Kraan, Lucitia; Ding, Yan; Sebat, Jonathan; Gleeson, Joseph G.

Cell ; 184(18): 4772-4783.e15, 2021 09 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34388390

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8496133
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.07.024

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7.

COVID-19 immune features revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas.

Ren, Xianwen; Wen, Wen; Fan, Xiaoying; Hou, Wenhong; Su, Bin; Cai, Pengfei; Li, Jiesheng; Liu, Yang; Tang, Fei; Zhang, Fan; Yang, Yu; He, Jiangping; Ma, Wenji; He, Jingjing; Wang, Pingping; Cao, Qiqi; Chen, Fangjin; Chen, Yuqing; Cheng, Xuelian; Deng, Guohong; Deng, Xilong; Ding, Wenyu; Feng, Yingmei; Gan, Rui; Guo, Chuang; Guo, Weiqiang; He, Shuai; Jiang, Chen; Liang, Juanran; Li, Yi-Min; Lin, Jun; Ling, Yun; Liu, Haofei; Liu, Jianwei; Liu, Nianping; Liu, Shu-Qiang; Luo, Meng; Ma, Qiang; Song, Qibing; Sun, Wujianan; Wang, GaoXiang; Wang, Feng; Wang, Ying; Wen, Xiaofeng; Wu, Qian; Xu, Gang; Xie, Xiaowei; Xiong, Xinxin; Xing, Xudong; Xu, Hao.

Cell ; 184(7): 1895-1913.e19, 2021 04 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33657410

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7857060
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.053

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8.

A role of PIEZO1 in iron metabolism in mice and humans.

Ma, Shang; Dubin, Adrienne E; Zhang, Yunxiao; Mousavi, Seyed Ali Reza; Wang, Yu; Coombs, Adam M; Loud, Meaghan; Andolfo, Immacolata; Patapoutian, Ardem.

Cell ; 184(4): 969-982.e13, 2021 02 18.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33571427

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7927959
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.024

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9.

Meta-analysis of tumor- and T cell-intrinsic mechanisms of sensitization to checkpoint inhibition.

Litchfield, Kevin; Reading, James L; Puttick, Clare; Thakkar, Krupa; Abbosh, Chris; Bentham, Robert; Watkins, Thomas B K; Rosenthal, Rachel; Biswas, Dhruva; Rowan, Andrew; Lim, Emilia; Al Bakir, Maise; Turati, Virginia; Guerra-Assunção, José Afonso; Conde, Lucia; Furness, Andrew J S; Saini, Sunil Kumar; Hadrup, Sine R; Herrero, Javier; Lee, Se-Hoon; Van Loo, Peter; Enver, Tariq; Larkin, James; Hellmann, Matthew D; Turajlic, Samra; Quezada, Sergio A; McGranahan, Nicholas; Swanton, Charles.

Cell ; 184(3): 596-614.e14, 2021 02 04.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33508232

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7933824
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.002

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10.

Spatially organized multicellular immune hubs in human colorectal cancer.

Pelka, Karin; Hofree, Matan; Chen, Jonathan H; Sarkizova, Siranush; Pirl, Joshua D; Jorgji, Vjola; Bejnood, Alborz; Dionne, Danielle; Ge, William H; Xu, Katherine H; Chao, Sherry X; Zollinger, Daniel R; Lieb, David J; Reeves, Jason W; Fuhrman, Christopher A; Hoang, Margaret L; Delorey, Toni; Nguyen, Lan T; Waldman, Julia; Klapholz, Max; Wakiro, Isaac; Cohen, Ofir; Albers, Julian; Smillie, Christopher S; Cuoco, Michael S; Wu, Jingyi; Su, Mei-Ju; Yeung, Jason; Vijaykumar, Brinda; Magnuson, Angela M; Asinovski, Natasha; Moll, Tabea; Goder-Reiser, Max N; Applebaum, Anise S; Brais, Lauren K; DelloStritto, Laura K; Denning, Sarah L; Phillips, Susannah T; Hill, Emma K; Meehan, Julia K; Frederick, Dennie T; Sharova, Tatyana; Kanodia, Abhay; Todres, Ellen Z; Jané-Valbuena, Judit; Biton, Moshe; Izar, Benjamin; Lambden, Conner D; Clancy, Thomas E; Bleday, Ronald.

Cell ; 184(18): 4734-4752.e20, 2021 09 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34450029

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8772395
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.08.003

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11.

Proteogenomic characterization of pancreatic ductal adenocarcinoma.

Cao, Liwei; Huang, Chen; Cui Zhou, Daniel; Hu, Yingwei; Lih, T Mamie; Savage, Sara R; Krug, Karsten; Clark, David J; Schnaubelt, Michael; Chen, Lijun; da Veiga Leprevost, Felipe; Eguez, Rodrigo Vargas; Yang, Weiming; Pan, Jianbo; Wen, Bo; Dou, Yongchao; Jiang, Wen; Liao, Yuxing; Shi, Zhiao; Terekhanova, Nadezhda V; Cao, Song; Lu, Rita Jui-Hsien; Li, Yize; Liu, Ruiyang; Zhu, Houxiang; Ronning, Peter; Wu, Yige; Wyczalkowski, Matthew A; Easwaran, Hariharan; Danilova, Ludmila; Mer, Arvind Singh; Yoo, Seungyeul; Wang, Joshua M; Liu, Wenke; Haibe-Kains, Benjamin; Thiagarajan, Mathangi; Jewell, Scott D; Hostetter, Galen; Newton, Chelsea J; Li, Qing Kay; Roehrl, Michael H; Fenyö, David; Wang, Pei; Nesvizhskii, Alexey I; Mani, D R; Omenn, Gilbert S; Boja, Emily S; Mesri, Mehdi; Robles, Ana I; Rodriguez, Henry.

Cell ; 184(19): 5031-5052.e26, 2021 09 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34534465

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8654574
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.08.023

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12.

Translocated microbiome composition determines immunological outcome in treated HIV infection.

Nganou-Makamdop, Krystelle; Talla, Aarthi; Sharma, Ashish Arunkumar; Darko, Sam; Ransier, Amy; Laboune, Farida; Chipman, Jeffrey G; Beilman, Gregory J; Hoskuldsson, Torfi; Fourati, Slim; Schmidt, Thomas E; Arumugam, Sahaana; Lima, Noemia S; Moon, Damee; Callisto, Samuel; Schoephoerster, Jordan; Tomalka, Jeffery; Mugyenyi, Peter; Ssali, Francis; Muloma, Proscovia; Ssengendo, Patrick; Leda, Ana R; Cheu, Ryan K; Flynn, Jacob K; Morou, Antigoni; Brunet-Ratnasingham, Elsa; Rodriguez, Benigno; Lederman, Michael M; Kaufmann, Daniel E; Klatt, Nichole R; Kityo, Cissy; Brenchley, Jason M; Schacker, Timothy W; Sekaly, Rafick P; Douek, Daniel C.

Cell ; 184(15): 3899-3914.e16, 2021 07 22.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34237254

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8316372
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.05.023

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13.

Impaired local intrinsic immunity to SARS-CoV-2 infection in severe COVID-19.

Ziegler, Carly G K; Miao, Vincent N; Owings, Anna H; Navia, Andrew W; Tang, Ying; Bromley, Joshua D; Lotfy, Peter; Sloan, Meredith; Laird, Hannah; Williams, Haley B; George, Micayla; Drake, Riley S; Christian, Taylor; Parker, Adam; Sindel, Campbell B; Burger, Molly W; Pride, Yilianys; Hasan, Mohammad; Abraham, George E; Senitko, Michal; Robinson, Tanya O; Shalek, Alex K; Glover, Sarah C; Horwitz, Bruce H; Ordovas-Montanes, Jose.

Cell ; 184(18): 4713-4733.e22, 2021 09 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34352228

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8299217
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.07.023

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14.

Single-cell protein activity analysis identifies recurrence-associated renal tumor macrophages.

Obradovic, Aleksandar; Chowdhury, Nivedita; Haake, Scott M; Ager, Casey; Wang, Vinson; Vlahos, Lukas; Guo, Xinzheng V; Aggen, David H; Rathmell, W Kimryn; Jonasch, Eric; Johnson, Joyce E; Roth, Marc; Beckermann, Kathryn E; Rini, Brian I; McKiernan, James; Califano, Andrea; Drake, Charles G.

Cell ; 184(11): 2988-3005.e16, 2021 05 27.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34019793

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https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.04.038

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15.

SARS-CoV-2 infection triggers profibrotic macrophage responses and lung fibrosis.

Wendisch, Daniel; Dietrich, Oliver; Mari, Tommaso; von Stillfried, Saskia; Ibarra, Ignacio L; Mittermaier, Mirja; Mache, Christin; Chua, Robert Lorenz; Knoll, Rainer; Timm, Sara; Brumhard, Sophia; Krammer, Tobias; Zauber, Henrik; Hiller, Anna Luisa; Pascual-Reguant, Anna; Mothes, Ronja; Bülow, Roman David; Schulze, Jessica; Leipold, Alexander M; Djudjaj, Sonja; Erhard, Florian; Geffers, Robert; Pott, Fabian; Kazmierski, Julia; Radke, Josefine; Pergantis, Panagiotis; Baßler, Kevin; Conrad, Claudia; Aschenbrenner, Anna C; Sawitzki, Birgit; Landthaler, Markus; Wyler, Emanuel; Horst, David; Hippenstiel, Stefan; Hocke, Andreas; Heppner, Frank L; Uhrig, Alexander; Garcia, Carmen; Machleidt, Felix; Herold, Susanne; Elezkurtaj, Sefer; Thibeault, Charlotte; Witzenrath, Martin; Cochain, Clément; Suttorp, Norbert; Drosten, Christian; Goffinet, Christine; Kurth, Florian; Schultze, Joachim L; Radbruch, Helena.

Cell ; 184(26): 6243-6261.e27, 2021 12 22.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34914922

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8626230
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.11.033

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16.

NNT mediates redox-dependent pigmentation via a UVB- and MITF-independent mechanism.

Allouche, Jennifer; Rachmin, Inbal; Adhikari, Kaustubh; Pardo, Luba M; Lee, Ju Hee; McConnell, Alicia M; Kato, Shinichiro; Fan, Shaohua; Kawakami, Akinori; Suita, Yusuke; Wakamatsu, Kazumasa; Igras, Vivien; Zhang, Jianming; Navarro, Paula P; Lugo, Camila Makhlouta; Noonan, Haley R; Christie, Kathleen A; Itin, Kaspar; Mujahid, Nisma; Lo, Jennifer A; Won, Chong Hyun; Evans, Conor L; Weng, Qing Yu; Wang, Hequn; Osseiran, Sam; Lovas, Alyssa; Németh, István; Cozzio, Antonio; Navarini, Alexander A; Hsiao, Jennifer J; Nguyen, Nhu; Kemény, Lajos V; Iliopoulos, Othon; Berking, Carola; Ruzicka, Thomas; Gonzalez-José, Rolando; Bortolini, Maria-Cátira; Canizales-Quinteros, Samuel; Acuna-Alonso, Victor; Gallo, Carla; Poletti, Giovanni; Bedoya, Gabriel; Rothhammer, Francisco; Ito, Shosuke; Schiaffino, Maria Vittoria; Chao, Luke H; Kleinstiver, Benjamin P; Tishkoff, Sarah; Zon, Leonard I; Nijsten, Tamar.

Cell ; 184(16): 4268-4283.e20, 2021 08 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34233163

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8349839
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.06.022

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17.

The Magnifying GLASS: Longitudinal Analysis of Adult Diffuse Gliomas.

Narayanan, Ashwin; Turcan, Sevin.

Cell ; 180(3): 407-409, 2020 02 06.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32032515

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18.

Key Parameters of Tumor Epitope Immunogenicity Revealed Through a Consortium Approach Improve Neoantigen Prediction.

Wells, Daniel K; van Buuren, Marit M; Dang, Kristen K; Hubbard-Lucey, Vanessa M; Sheehan, Kathleen C F; Campbell, Katie M; Lamb, Andrew; Ward, Jeffrey P; Sidney, John; Blazquez, Ana B; Rech, Andrew J; Zaretsky, Jesse M; Comin-Anduix, Begonya; Ng, Alphonsus H C; Chour, William; Yu, Thomas V; Rizvi, Hira; Chen, Jia M; Manning, Patrice; Steiner, Gabriela M; Doan, Xengie C; Merghoub, Taha; Guinney, Justin; Kolom, Adam; Selinsky, Cheryl; Ribas, Antoni; Hellmann, Matthew D; Hacohen, Nir; Sette, Alessandro; Heath, James R; Bhardwaj, Nina; Ramsdell, Fred; Schreiber, Robert D; Schumacher, Ton N; Kvistborg, Pia; Defranoux, Nadine A.

Cell ; 183(3): 818-834.e13, 2020 10 29.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33038342

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7652061
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2020.09.015

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19.

Tau PTM Profiles Identify Patient Heterogeneity and Stages of Alzheimer's Disease.

Wesseling, Hendrik; Mair, Waltraud; Kumar, Mukesh; Schlaffner, Christoph N; Tang, Shaojun; Beerepoot, Pieter; Fatou, Benoit; Guise, Amanda J; Cheng, Long; Takeda, Shuko; Muntel, Jan; Rotunno, Melissa S; Dujardin, Simon; Davies, Peter; Kosik, Kenneth S; Miller, Bruce L; Berretta, Sabina; Hedreen, John C; Grinberg, Lea T; Seeley, William W; Hyman, Bradley T; Steen, Hanno; Steen, Judith A.

Cell ; 183(6): 1699-1713.e13, 2020 12 10.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33188775

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8168922
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2020.10.029

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20.

Identification of ALK in Thinness.

Orthofer, Michael; Valsesia, Armand; Mägi, Reedik; Wang, Qiao-Ping; Kaczanowska, Joanna; Kozieradzki, Ivona; Leopoldi, Alexandra; Cikes, Domagoj; Zopf, Lydia M; Tretiakov, Evgenii O; Demetz, Egon; Hilbe, Richard; Boehm, Anna; Ticevic, Melita; Nõukas, Margit; Jais, Alexander; Spirk, Katrin; Clark, Teleri; Amann, Sabine; Lepamets, Maarja; Neumayr, Christoph; Arnold, Cosmas; Dou, Zhengchao; Kuhn, Volker; Novatchkova, Maria; Cronin, Shane J F; Tietge, Uwe J F; Müller, Simone; Pospisilik, J Andrew; Nagy, Vanja; Hui, Chi-Chung; Lazovic, Jelena; Esterbauer, Harald; Hagelkruys, Astrid; Tancevski, Ivan; Kiefer, Florian W; Harkany, Tibor; Haubensak, Wulf; Neely, G Gregory; Metspalu, Andres; Hager, Jorg; Gheldof, Nele; Penninger, Josef M.

Cell ; 181(6): 1246-1262.e22, 2020 06 11.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32442405

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